Proline נמצא לעתים קרובות בסוף סליל α או בסיבובים או לולאות. בניגוד לחומצות אמינו אחרות הקיימות כמעט אך ורק בטרנספורמציה בפוליפפטידים, פרולין יכול להתקיים בתצורת cis בפפטידים.
האם סלילי אלפא מכילים שאריות פרולין?
עכשיו, כשיש יותר מ-30,000 מבני חלבון ב-Protein Data Bank, ברור ששיירי פרולין נמצאים ב-α-helices, שם הם ממלאים לעתים קרובות תפקידים חשובים במבנה ובתפקוד של החלבון.
אילו חומצות אמינו נמצאות בסליל אלפא?
כל אחת מ-20 חומצות האמינו יכולה להשתתף ב-α-helix אבל חלקן מועדפות יותר מאחרות. Ala, Glu, Leu ו-Met נמצאים לרוב בסליל, בעוד ש-Gly, Tyr, Ser ו-Pro נוטים פחות להיראות.
האם גיליונות בטא מכילים פרולין?
Proline אינו מועדף במבני גיליונות בטא מכיוון שהוא אינו יכול להשלים את רשת H-bonding. כאשר פרולין אכן מתרחש ביריעות, הוא עשוי להיות בבליטה או בקצה יריעה שבה היעדר תורם קשר מימן אמינו אינו קריטי.
מה מכיל סלילי אלפא?
סליל האלפא (α-helix) הוא מוטיב נפוץ ב-המבנה המשני של חלבונים והוא מבנה סליל ימני שבו כל עמוד השדרה של קבוצת N-H מימן קשרים לעמוד השדרה C=O. קבוצה של חומצת האמינו הממוקמת ארבעה שיירים קודם לכן לאורך רצף החלבון.
