Arabinose הוא סוכר בן חמישה פחמנים שנמצא בטבע ויכול לשמש כמקור פחמן יחיד בחיידקים רבים. תוצרי החלבון משלושה גנים (araB, araA ו-araD) נחוצים לפירוק ארבינוז בבני משפחת ה-Enterobacteriaceae, כגון E. coli ו-S.
מה עושה ארבינוז לחיידקים?
לכן כאשר ארבינוז קיים כדי להפעיל את אופרון הערבינוז, GFP מיוצר והחיידקים יכולים להפליא. ללא ארבינוז, הגן GFP אינו מתבטא ואין פלואורסצנטיות. אז על ידי שינוי הרכב חומרי הזנה, חוקר יכול לשלוט מתי (ואם) הפריחה מתרחשת בחיידקים שעברו טרנספורמציה.
מה תפקידו של ארבינוז בטרנספורמציה של חיידקים?
Arabinose פועל כמווסת אלוסטרי של AraC, ומשנה לאילו אתרי DNA הוא נקשר וכיצד הוא יוצר דימר. זכרו שארבינוז הוא הסוכר שמתפרק על ידי החלבונים של האופרון AraBAD. כאשר מוסיפים ארבינוז לסביבה שבה חי E. coli, הוא נקשר בחוזקה ל-AraC.
למה משתמשים בארבינוז?
שימוש בביולוגיה
בביולוגיה סינתטית, ארבינוז משמש לעתים קרובות כ- מתג חד-כיווני או הפיך לביטוי חלבון תחת Pbadמקדם ב-E. coli. ניתן לבטל את המתג הזה על ידי נוכחות של גלוקוז או לבטל על ידי הוספת גלוקוז במצע התרבות שהוא סוג של דיכוי קטבוליטים.
איךהאם ארבינוז משפיע על ויסות גנים וביטוי בחיידקים?
כאשר קיים ארבינוז, araC מרגיע את תצורת ה-DNA כך שתעתוק יכול להתרחש, אך כאשר פחמימה זו נעדרת, אותו חלבון מגביל את ה-DNA להפחית את יכולתו להיקשר עם RNA פולימראז.
