היכן נמצאים אתרי רגישות יתר של DNase I ומה הם מעידים על אופי הכרומטין? אתרים אלו נמצאים ב-צומת האקסון-אינטררון ומציינים את האתר של ביקוע ה-mRNA במהלך השחבור. אתרים אלה נמצאים באקראי בכל הגנום וזה הופך את ה-DNA לפגיע להתפרקות.
מהו אתר רגיש יתר ל-DNase I וכיצד הוא משפיע על הכרומטין?
בגנטיקה, אתרי רגישות יתר של DNase I (DHSs) הם אזורים של כרומטין שרגישים לביקוע על ידי האנזים DNase I. באזורים הספציפיים הללו של הגנום, הכרומטין איבד את המבנה המעובה שלו, חושף את ה-DNA והופך אותו לנגיש.
מה מציע אתר בעל רגישות יתר של DNase?
אלמנטים רגולטוריים פעילים ב-cis רגישים יתר לביקוע על ידי האנדונוקלאז DNase I. מוטיבים בתוך אתרים רגישים ל-DNase I מצביעים על תפוסת גורם טרנס-אקטואלי וכן, בשילוב עם DNase I נתוני מחשוף, יכולים לשמש לבניית רשתות רגולטוריות זמניות.
מהו בדיקת רגישות יתר של DNase?
במשך יותר משני עשורים, מבחן רגישות יתר של DNase I (DHA) היה מכשיר לגילוי תחומים רגולטוריים (11). שיטה זו ממפה אתרים נפרדים בגנום שבהם הקונפורמציה של הכרומטין הופכת את ה-DNA שלו לרגיש יתר לביקוע על ידי האנדונוקלאז DNase I (12).
מהו אתר רגיש לגרעין בכרומטין?
Inמאמינים כי כרומטין, אזורים נטולי נוקלאוזומים הידועים כאתרים רגישים לגרעיניאזות מייצגים את "החלונות הפתוחים" המאפשרים גישה משופרת של רצפי DNA חיוניים הפועלים ב-cis לגורמים טרנס-פועלים (ראה Refs.