לעומת זאת, רוב ליגזות ה-DNA האוקריוטיות, יחד עם אנזימים ארכאיים ובקטריופאג'ים, נופלות בתת-המשפחה השנייה; האנזימים האלה משתמשים ב-ATP כקו-פקטור.
האם ליגאזות דורשות ATP?
נעשה שימוש נפוץ בשתי ליגזות DNA. … T4 ligase דורש ATP בעוד E. coli ligase דורש NAD+ (ניקוטינאמיד אדנין דינוקלאוטיד הוא קו-אנזים המורכב מ-2 nt המחוברים דרך קבוצות הפוספט שלהם). שניהם מזרזים את החיבור של 5'-פוספט וקבוצת 3'-OH ליצירת קשר פוספודיסטר.
למה ליגזות צריך ATP?
שני השלבים של תגובת קשירת ה-DNA
לתגובת קשירת ה-DNA עצמה יש שני שלבים בסיסיים. ראשית קצוות ה-DNA צריכים להתנגש במקרה ולהישאר ביחד מספיק זמן כדי שהליגאזה תצטרף אליהם. … כדי לאפשר לאנזים לבצע תגובות נוספות יש למלא את ה-AMP באתר הפעיל של האנזים על ידי ATP.
מה תפקידן של ליגזות?
ליגזות DNA ממלאות תפקיד חיוני ב-שמירה על שלמות גנומית על ידי הצטרפות של שברים בעמוד השדרה הפוספודיסטר של ה-DNA המתרחשות במהלך שכפול ורקומבינציה, וכתוצאה מנזק ל-DNA ושלו לְתַקֵן. שלושה גנים אנושיים, LIG1, LIG3 ו-LIG4 מקודדים ליגזות DNA תלויות ATP.
מהן ליגזות האם הן פועלות באופן אקטיבי או פסיבי?
DNA ligase פעיל במהלך השכפול, תהליך התיקון והריקומבינציה של DNA. זה מיושם באופן נרחב בתיקון של גדיל אחדשברים ב-DNA דופלקס של יצורים חיים באמצעות הגדיל המשלים של הסליל הכפול כתבנית, בעוד שצורות מסוימות עשויות לתקן באופן ספציפי נזקים כפולים.
