חלבוני Activator נקשרים ל-אתרים רגולטוריים ב-DNA בקרבת מקום לאזורי מקדם הפועלים כמתגי הפעלה/כיבוי. קשירה זו מקלה על פעילות RNA פולימראז ותעתוק של גנים קרובים.
היכן מתחברים מפעילים ומדכאים?
מקטעי DNA ליד הפרומוטור משמשים כאתרים קושרים חלבונים - רוב האתרים הללו מכונים אופרטורים - לחלבונים מווסתים הנקראים אקטיבטורים ומדכאים. עבור גנים מסוימים, הקישור של חלבון מפעיל לאתר היעד של ה-DNA שלו הוא תנאי הכרחי לתחילת התעתוק.
לאן נקשר אקטיבטור?
רוב הפעילים נקשרים ל-החריצים העיקריים של הסליל הכפול, מכיוון שאזורים אלה נוטים להיות רחבים יותר, אבל יש כאלה שייקשרו לחריצים הקטנים. אתרים מחייבי מפעיל עשויים להיות ממוקמים קרוב מאוד למקדם או למספר זוגות בסיסים משם.
למה נקשר החלבון המפעיל?
החלקים של חלבון אקטיבטור: תחום ה-DNA המחייב (שנצמד ל-אתר הזיהוי ב-DNA) ותחום ההפעלה, שהוא ה"קצה העסקי" של המפעיל שלמעשה מקדם שעתוק, למשל, על ידי הקלת היווצרות של קומפלקס התחלת התעתוק.
היכן יקשר אקטיבטור לאופרון הזה?
מפעיל נקשר בתוך האזור הרגולטורי של אופרון, ועוזר ל-RNA פולימראז להיקשר למקדם, ובכךשיפור התמלול של האופרון הזה. משרה משפיע על שעתוק באמצעות אינטראקציה עם מדכא או מפעיל. האופרון trp הוא דוגמה קלאסית לאופרון שניתן להדחיק.
