בביולוגיה מולקולרית, STRING (כלי חיפוש לאחזור של גנים/חלבונים באינטראקציה) הוא מסד נתונים ביולוגי ומשאב אינטרנט של אינטראקציות חלבון-חלבון ידועות וחזוויות. … הגרסה האחרונה 11b מכילה מידע על כ-24,5 מיליון חלבונים מיותר מ-5000 אורגניזמים.
מה המטרה של מסד הנתונים של STRING?
מסד הנתונים של STRING שואף לאסוף ולשלב מידע זה, על ידי איחוד חלבון ידוע וחזוי–נתוני שיוך חלבון עבור מספר רב של אורגניזמים.
מהו ציון של STRING?
ב-STRING, כל אינטראקציה של חלבון-חלבון מסומנת ב'ניקוד' אחד או יותר. חשוב לציין, ציונים אלה אינם מצביעים על החוזק או הספציפיות של האינטראקציה. במקום זאת, הם אינדיקטורים לאמון, כלומר עד כמה STRING שופט אינטראקציה נכונה, בהתחשב בראיות הזמינות.
למה יש אינטראקציה בין חלבונים?
אינטראקציות חלבון-חלבון (PPIs) הן מגעים פיזיים בעלי סגוליות גבוהה שנוצרו בין שתי מולקולות חלבון או יותר כתוצאה מאירועים ביוכימיים המנווטים על ידי אינטראקציות הכוללות כוחות אלקטרוסטטיים, מימן התקשרות והאפקט ההידרופובי.
מהו שיוך פונקציונלי?
הגדרה. קשר בינארי בין ישויות ביולוגיות כאשר אחת מהן מווסתת את השנייה במונחים של תפקוד, ביטוי, השפלה או יציבות של האחר והקשרלא ניתן לקבוע בין השותפים שישירים, ולכן שלבי ביניים קיימים באופן מרומז.
