השחקן העיקרי במנגנון הקטליטי בפרוטאזות הסרין הוא טריאד הקטליטי טריאדה קטליטית טריאדה קטליטית היא קבוצה של שלוש חומצות אמינו מתואמות שניתן למצוא ב-Active אתר של כמה אנזימים. טריאדות קטליטיות נמצאות לרוב באנזימי הידרולאז וטרנספראז (למשל פרוטאזות, אמידאזות, אסטראזות, אצילות, ליפאזות ו-β-לקטמאסות). https://en.wikipedia.org › ויקי › Catalytic_triad
טריאדה קטלטית - ויקיפדיה
. … לסרין יש קבוצת -OH המסוגלת לפעול כנוקלאופיל, לתקוף את הפחמן הקרבונילי של הקשר הפפטידי השבר של המצע.
איך מעכבי סרין פרוטאז פועלים?
מעכבי סרין פרוטאז, או סרפינים, מהווים משפחה של חלבונים ש מנוגדים את הפעילות של פרוטאזות סרין. … במנגנון זה, הסרפין מציג רצף פפטיד המחקה מצע - לולאת המרכז התגובתי-לפרוטאז הסרין היעד שלו.
איזה תפקיד במנגנון התגובה של סרין פרוטאז ממלא מערכת ממסר המטען?
תפקידו של Asp102 במערכת הממסר הקטליטי של פרוטאזות סרין נחקר באופן תיאורטי על ידי חישוב פרופילי האנרגיה החופשית של תגובת העברת הפרוטונים הבודדת על ידי הטריפסין המוטנטי Asn102 וה- תגובת העברת פרוטונים כפולה (מה שנקרא מנגנון ממסר המטען) של טריפסין מסוג פרא.
איזה מהאפשרויות הבאות היא דוגמה לסרין פרוטאז?
Chymotrypsin: >משמש כדוגמה לפרוטאז סרין מכיוון שהמבנה והמנגנון שלו מובנים היטב.
מהן הסיבות לכינוי הפרוטאזות הסרין?
הם נקראים פרוטאזות הסרין משתי סיבות:
- הם עושים הידרוליזה של חלבונים.
- יש להם שארית Ser חיונית באתר הפעיל, שהיא קריטית לקטליזה. למעשה הסר הזה הוא הרבה יותר תגובתי מסרינים אחרים בחלבון.
