מאחר ש-סוניציציה עלולה לבזות חלבונים ולבטל אפיטופים של חלבונים, בשלב הבא הערכנו את ההשפעה של sonication על שלמות החלבון.
האם קולי קול יכול לפגוע בחלבונים?
תשובות פופולריות (1)
פרוטוקול קולי סטנדרטי לא יכול לגרום לפיצול חלבון- האנרגיה נמוכה מדי. זה אפילו לא אמור לגרום לדנטורציה שלו. זה יכול להיות דנטורטי כאשר אתה עושה צלילים אותו זמן רב מדי ומחמם יתר על המידה את הדגימה. אם אתה משתמש בכרומטוגרפיה של ניקל, רצועות אחרות עשויות להיות פשוט זיהומים.
האם קולי קול לשבור קשרי פפטידים?
Sonication בדרך כלל לא יכולה לפרק את המבנה הראשוני של חלבון מכיוון שהמבנה הזה (רצף חומצות האמינו) בנוי מקשרים קוולנטיים שהם הרבה פעמים חזקים יותר מקשרי מימן ו-sonication יכול לספק את האנרגיה הדרושה כדי לשבור את הקשרים האלה.
האם קולי שובר את הממברנה הגרעינית?
A סוניציה קצרה עם אנרגיה נמוכה יכולה לשבש את קרום הפלזמה מבלי לשבור יותר מדי ממברנות מיטוכונדריות או גרעיניות, תוך כניעה במיטוכונדריה טקטית.
האם ביצוע קולי הכרחי למיצוי חלבון?
מיסוס חומרי ניקוי (למשל, SDS) הנדרש לבידוד של חלבוני ממברנה מביא לדבק כמו ליסט בעיקר בגלל חומצות גרעין. לפיכך נדרשת קולי במקרים כאלה כדי לשבש חומצות גרעין אלו. קולי מייצר הרבה חום ואינו טוב עבורחלבונים רבים.
