BLAST יכול לשמש לכמה מטרות. אלה כוללים זיהוי מינים, איתור תחומים, ביסוס פילוגניה, מיפוי DNA והשוואה. עם השימוש ב-BLAST, אתה יכול אולי לזהות בצורה נכונה מין או למצוא מינים הומולוגיים.
למה משמשים BLAST?
BLAST הוא אלגוריתם מחשב הזמין לשימוש מקוון באתר המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגיה (NCBI), כמו גם באתרים רבים אחרים. BLAST יכול ליישר ולהשוות במהירות רצף DNA של שאילתה עם מסד נתונים של רצפים, מה שהופך אותו לכלי קריטי במחקר גנומי מתמשך.
מהי טכניקת BLAST?
טכניקת ה-BLAST היא שיטת פתרון תלונות שפותחה על ידי Albert Barneto . המנמונית מייצגת להאמין, להקשיב, להתנצל, לספק ולהודות (טבלה 1). 6. מאמר זה מתאר את התועלת שלו בטיפול בחולים וככלי הוראה קליני.
איך BLAST עובד ב-DNA?
איך BLAST עובד? BLAST מזהה רצפים הומולוגיים באמצעות שיטה היוריסטית אשר מוצאת בתחילה התאמות קצרות בין שני רצפים; לפיכך, השיטה לא לוקחת בחשבון את כל מרחב הרצף. לאחר התאמה ראשונית, BLAST מנסה להתחיל יישורים מקומיים מההתאמות הראשוניות הללו.
למה BLAST מהיר יותר מפסטה?
מבחינת מורכבות זמן הריצה של האלגוריתם, BLAST מהיר יותר מ-FASTA על ידי חיפוש רק אחר הדפוסים המשמעותיים יותר ב-רצפים. הרגישות (או הדיוק) של BLAST ו-FASTA נוטה להיות שונה עבור רצפי חומצות גרעין וחלבונים (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
